एक नए जीवाणु स्ट्रेन की ज्ञात जातियों से 16S rRNA अनुक्रम समानता 95% से कम है। यह निर्धारित करने के लिए कि यह नई जाति है या नहीं, सबसे विश्वसनीय अगला चरण क्या है?
- AGC मात्रा की जाँच
- BBLAST खोज चलाना
- Cइलेक्ट्रॉन सूक्ष्मदर्शी से आकारिकी देखना
- Dऔसत न्यूक्लियोटाइड समानता (ANI) विश्लेषण करना
उत्तर और व्याख्या देखें
सही उत्तर: (d) औसत न्यूक्लियोटाइड समानता (ANI) विश्लेषण करना
व्याख्या
लगभग 98.7% से कम 16S rRNA समानता संकेत देती है कि जीवाणु नई जाति का हो सकता है, पर 16S rRNA अकेले इसका निर्णय करने के लिए बहुत एकरूप है।
औसत न्यूक्लियोटाइड समानता (ANI) नए स्ट्रेन के पूरे जीनोम की तुलना उसकी निकटतम ज्ञात जातियों से करती है। लगभग 95–96% से कम ANI अब अलग जाति का मान्य मानक है; यह पुराने 70% DNA–DNA संकरण नियम के तुल्य है।
- GC मात्रा जाति को परिभाषित करने के लिए बहुत कम और बहुत असमान रूप से बदलती है।
- BLAST खोज पहली छँटाई है, प्रमाण नहीं।
- आकारिकी जीवाणुओं में भ्रामक हो सकती है, जो प्रायः एक जैसे दिखते हैं।